جایگاه حفاظتی و نقش باغ‌وحش‌ها در صیانت از گونه‌های جانوری، یکی از مهم‌ترین کارکردهای این مجموعه‌ها در سراسر جهان است؛ نقشی که در باغ‌وحش ارم نیز با جدیت دنبال می‌شود.

  گورخر ایرانی از گونه‌های باارزش و در معرض خطر انقراض کشور است که در مناطقی همچون کویر مرکزی ایران، پارک ملی توران و پارک ملی قصر بهرام زیست می‌کند. با توجه به روند کاهشی جمعیت این گونه در طبیعت، تکثیر آن در مراکز حفاظتی اهمیت ویژه‌ای دارد. در همین راستا، به گزارش روابط عمومی شرکت ارم سبز، باغ وحش ارم موفق شده است یک رأس گورخر ایرانی ماده را در باغ‌وحش تکثیر کند؛ اتفاقی امیدبخش که می‌تواند سرآغازی برای مشارکت مؤثرتر باغ‌وحش‌ها در حفاظت از گونه‌های جانوری و بازگرداندن آن‌ها به زیستگاه‌های طبیعی باشد.

 از سوی دیگر، یکی از نمونه‌های ارزشمند دیگر، گوزن زرد ایرانی است؛ گونه‌ای که در طبیعت ایران و جهان با خطر انقراض مواجه شده و بخش قابل‌توجهی از جمعیت باقی‌مانده آن در مراکز نگهداری حفظ می‌شود. باغ‌وحش ارم هر سال موفق به تکثیر تعدادی از این گونه ارزشمند می‌شود و پیش از این نیز شماری از گوزن‌های زرد ایرانیِ تکثیرشده در این مجموعه، به پارک ملی فندقلو در استان اردبیل منتقل و در طبیعت رهاسازی شده‌اند. 

تداوم چنین برنامه‌هایی می‌تواند گامی مهم در مسیر حفظ حیات‌وحش، جلوگیری از انقراض گونه‌های بومی و ارتقای تنوع زیستی کشور عزیزمان ایران.